一、原位杂交仪应用
①细胞特异性mRNA转录的定位，可用于基因图谱，基因表达和基因组进化的研究；
②感染组织中病毒DNA/RNA的检测和定位，如EB病毒mRNA、人类乳头状瘤病毒和巨细胞病毒DNA的检测；
③癌基因、抑癌基因及各种功能基因在转录水平的表达及其变化的检测；
④基因在染色体上的定位；
⑤检测染色体的变化，如染色体数量异常和染色体易位等；
⑥分裂间期细胞遗传学的研究，如遗传病的产前诊断和某些遗传病基因携带者的确定，某些肿瘤的诊断和生物学剂量测定等。
二、注意事项
1、固定液的选择及固定时间 石蜡组织建议用10%中性缓冲福尔马林固定6～48h，其它固定液对实验结果可能产生一定的影响。 组织离体后应尽快固定，建议在标本离体后30min内固定。如样本固定不及时，荧光信号会减弱。 固定液的体积是组织体积的4～20倍，否则固定不充分，容易出现无信号或者信号很弱的现象。 而且，为了保证信号的准确性，蜡块在2年内进行检测，已经切好的切片在6周内检测。
2、组织切片和载玻片的选择 组织切片4～5μm 厚，过厚或过薄的切片均会对信号的强弱产生影响，而且切片应完整，质量良好，否则会在预处理时掉片。 载玻片的选择建议使用防脱载玻片，有条件的实验室可使用更好的阳离子或者阴离子专用载玻片，可有效防止脱片现象的发生。